随着公交格局的改变，营运的线路也从之前的混合经营，逐渐按走向、行驶区域划分。公交管理越来越规范，服务标准也执行得越来越严格，却掩盖不住公交企业亏损、A 1牌照司机流失严重等问题。

　　惠州有公交车至今，已经有44年之久。惠城中心区的公交线路，也从最初的一条，增加至现在的60多条。惠州的公交管理也越来越规范。

　　整合升级　多卡可同刷

　　公交行业的另一大变化，是刷卡越来越方便。2004年5月，惠州市公汽总公司投资150多万元，组建完成了公交IC卡收费系统，先在无人售票的18路186台车上试行。惠州公交开启了刷卡时代。2011年，为了实现珠三角交通对接融合，“岭南通·惠州通”进驻惠州公交车，市民拿岭南通卡可以在珠三角其他地市的公交车上刷卡乘车。2012年，全市1163辆公交、农村客运车辆开始刷岭南通卡，全市设置了56个售卡、充值点。

　　岭南通卡开刷后，惠州市公汽总公司的车上出现了一个难题。部分公交车实行有人售票，乘务员会背着手持刷卡机刷公交IC卡，岭南通卡开刷后，就需要另外背着一个岭南通刷卡机。为此，惠州市交通局引导两套系统升级兼容，到2013年5月，公交IC卡、岭南通刷卡机正式“合体”，刷卡从此更方便了。

　　2008年惠州开始安装了智能电子公交站牌，公交车还有几站才到，电子牌会自动倒计数，让人们等公交更加心里有数。这一智能措施，引得中山、江门、韶关、花都、接昂等地公交公司来参观学习。

　　2014年12月，惠州市区的100辆公交车上，还安装了导盲系统，并为600名盲人配送导盲终端机，方便盲人和弱视者乘坐公交出行。公交服务一步步贴心升级。